В народной медицине дурнишник нашел широчайшее применение. Отвар из семян растения пьют при болезнях мочевого пузыря, дизентерии и золотухе. Наружно плоды и семена рекомендуют для лечения параличей, при экземах и дерматозах, от зудящих укусов насекомых. Настой дурнишника уменьшает щитовидную железу, применяется при острых и хронических бронхитах, спазмах в области желудка, атонии кишечника, камнях в почках. Его рекомендуют как средство, стимулирующее пищеварение, усиливающее секрецию потовых желез, в качестве жаропонижающего средства при простудах и в качестве седативного средства при нетяжелых нервных заболеваниях. В качестве легкого обезболивающего его пьют при болезненных менструациях. Наружно отвар травы и корня дурнишника применяют при различных кожных заболеваниях, фурункулезе, проказе. Свежий сок травы когда-то давали детям от крапивницы, его рекомендуют принимать от ангины, зоба, злокачественных опухолей, смазывать соком места, пораженные золотухой, лишаем, экземы. От сыпи и золотушных струпьев, грибковых поражений, целители рекомендуют применять растертые в кашицу свежие листья растения или в осенне-зимний период его масло. Маслом дурнишника лечат крапивницу, дерматит, псориаз, экземы, акне, фурунуклез, различные аллергические реакции. Внутренне его принимают при нарушениях йодного обмена и йододефиците, от спазмов в горле, ангины, энтероколита и дизентерии.
Народная медицина приписывает дурнишнику свойство подавлять рост раковых клеток.