Омежник представляет собой растение высотой 40-150 см, имеющее ветвистый стебель и ветвящиеся, нитевидные корни. Корни распространяются на большую площадь, так они получают все необходимые питательные вещества с поверхности болотистой почвы.
Стебель является полым и хрупким, ребристым. Стебель традиционно в диаметре составляет не более 30 мм, его надводная часть покрыта воздушными листьями. Они могут быть дважды и многократно рассеченными. У омежника есть подводные листья с нитевидными конечными долями.
Примечательно, что омежник может быть и двулетним растением, и многолетним. Узнать его среди собратьев несложно. Нижняя часть растения обычно скрыта под водой, она включает укороченные междоузлия с корешками. Растение вех малый, как его называют в народе, цветет с начала лета до начала осени. Плодоносить оно начинает в августе и сентябре. Цветы омежника водного белого цвета, мелкие, собранные в зонтики. Зонтики у Oenanthe aquatica многочисленные, пазушного типа, или расположенные супротивно листьям, щитковидные. В диаметре они достигают 10 мм, с 8-15 голыми лучами.
Эти цветочки – пятичленные, их чашечка пятизубчатая, а венчик – пятилепестной. Тычинки могут быть с рано опадающими обертками или без оберток, всего их пять. Лепесточки цветков на верхушке выемчатые, их доля отогнута внутрь. У краевых цветков доли чаще всего увеличенные. Другие виды омежника могут иметь не только белые цветочки, но и розоватые.
Узнать омежник можно и по плодам. Это ядовитое растение имеет плоды эллиптически-удлиненной формы длиной не более 5 мм. Отличительная черта – тонкая плодоножка, наличие двух односемянных створок.