В народной медицине используются надземные части растения: стебли, листья, цветки. Применяется зюзник для лечения базедовой болезни и для уменьшения узлов щитовидной железы. Зюзник хорош тем, что превысить дозировку практически невозможно. Это свойство очень ценно для ослабленных больных гипертиреозом.
Растение с успехом применяют для лечения неврозов и расстройств нервной системы, бессонницы, беспричинного чувства страха. Настой травы считается хорошим средством в борьбе с приступами тяжёлого сердцебиения, при нарушениях сердечного ритма (экстрасистолии), учащенном сердцебиении, гипертонической болезни. Замедляя пульс, делая его более глубоким и ровным, полезные вещества зюзника помогают нормализации состояний пациентов с сердечными заболеваниями. Особенно хорошо зюзник действует в сочетании с пустырником.
Используют зюзник европейский и при других гормональных изменениях, например, нарушениях менструального цикла, мастопатии.
Зюзник европейский в народной медицине применяется для лечения заболеваний, сопровождающихся интоксикацией, высокой температурой.
Содержащиеся в зюзнике танины отлично справляются с затяжным кашлем.
Экстракты зюзника положительно действуют на состав крови. Хорошо помогает трава и от кровотечений, благодаря содержащимся в составе кровоостанавливающим веществам.
При добавлении зюзника в многокомпонентные сборы обязательно нужно учесть, что растение снижает давление и обладает мочегонными свойствами, поэтому зюзник используют еще и в качестве противоотечного средства.