Куколь обыкновенный - травянистое растение высотой 30-80 см, равномерно негусто войлочноопушенное простыми, длинными, мягкими, серыми, более или менее прижатыми волосками. Корень стержневой, тонкий, слабоветвистый. Стебель простой или вверху с немногочисленными отклонёнными ветвями, прямостоячий, округлый, удлинённый, облиственный.
Листья без прилистников, простые, супротивные, сидячие, в основании слегка сросшиеся, линейные или линейно-ланцетные, острые, цельнокрайние, перистонеровные, цельные, длиной 3-13 см, шириной 2-10 мм.
Цветки у коколя обыкновенного достаточно крупные, расположены поодиночке на концах стебля и веточек, полные, циклические, правильные. Чашечка спайнолистная, рассечена глубже половины на 5 линейных долей, длиной 2-3 см, шириной около 2 мм, превышающих трубку. Трубка чашечки длиной 1,5-2 см. На поверхности чашечки хорошо заметны 10 выступающих жилок. Венчик без прицветника, раздельнолепестный, более короткий, чем чашечка, с пятью цельными обратнояйцевидными тёмно-розовыми лепестками и слабо-выемчатым отгибом на верхушке, переходящим в ноготок, несущий две продольные крыловидные полоски. Андроцей из десяти свободных тычинок в два круга; цветок обдиплостемонный; наружные тычинки в основании прирастают к лепесткам; тычиночная нить тонкая, длиннее ноготка; пыльник продолговатый, раздвоенный, качающийся, интрорзный. Гинецей лизикарпный, из пяти плодолистиков, пестик один.
Завязь верхняя, одногнездная, с центральной плацентой. Столбиков пять, длинных, с нитевидными волосистыми, слегка закрученными рыльцами.
Плод - одногнездная коробочка, многосеменная, яйцевидная, превышающая трубку чашечки, вскрывающаяся на верхушке пятью короткими зубчиками, содержит 30-40 семян. Семена крупные, длиной 2,5-3,5 мм, округло-почковидные, слегка сплюснутые, почти чёрные, покрыты концентрическими рядами острых шипиков.
Куколь распространяется семенами, которые обладают почти стопроцентной всхожестью и сохраняют её до 10 лет. Они могут прорастать как весной, так и осенью, причём осенние всходы хорошо перезимовывают.